mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT AGAGCTTTCTTCAGTCCACTC TTAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCGGTAGGATTTAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAAATACTGAGTTAAAAAGTTCAGAAAACAAAAGGGGCGGGTGCTGTAGAAAAGAAGGTTTACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTACT 4 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR159 1e-116 ptc-MIR319a 6e-38 -80.5 ..(((.(((((..((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..(((((((..((....(((((........)))))..............(((((((...........)))..))))......))..)))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...))))))))))..))))).))).... (-80.50)