mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT AGAGCTCTCTTCAGTCCACTC TTAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCATGGGCGGGCGAAGGTTTTGAATTATCTGCCGACTCATTCATTCAAACACACTAGAAAAGGGAGCATTAAAGATAGCTGCTATTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGATAAATTTCATACTTCTCTTCTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTAGC 2 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR159 6e-103 ptc-MIR319c 2e-62 -78.1 ..(((.(((((((((((((((((..((((((..((.((((....((((((((((.(((..((((((((.((..((((.(((...((....(......)....)).))).))))..)).))))))))..))).))))))..))))..)))).))..))))))..))))))))))))))))).))).... (-78.10)