mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT GGAGCTCCTTTCAGTCCAATA CCAAAGGAGCTCCTTTCAGTCCAATATGGAGGGCTTAGAAGCGGCAAAGAGCTGCCATCTCATGCATTAAGGCAATACTTGACAAGTTTTTCACAGTGAAAATCTCAAGTTTGGCCTGGTGCATGGTGTGGGAGCAACTCCTTCCCTCCTTCCCCCACCCATTGGACTGAAGGGAGCTCCTTCTTTC 0 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR159 2e-102 ptc-MIR319h 7e-16 -89.4 ...((((((((((((((((((((((.(((.(((...((.((.((.((.(((((.((((..(((((((((.(((...((((((.....(((((.....)))))..))))))...))))))))))))..)))).)))...)).)))))).)).))))))...))))))))))))))))))))))..... (-89.40)