mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGCGATCCCTTAGGAAG AAAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCTAATGTCGTTGGGTACCTAAATGAGTTAATTATAAATCTATAATCCAATTCATTGGATCATGCGATCCCTTAGGAAGTCTCC 1 1 5' arm Ricinus_communis mirbase 100 ptc-MIR393d 0.000000005 -43.06 ....((((.((((((((((((.(((((((((..(((((((......((((.....)))).........))))))).))))))))))))))))))))).))))...... (-43.06)