mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTGAGTGCAGCGTTGATG CCAGCGCTGCATTCAATCATG AAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATTCCCCTACATGACATATTTCTGTTGGTTAATTCATTACCAATATCCCTTCTTTAAAAAAAGAAGTAAACCTTTTTGGGAATAGATGGTTTTGGATGATTTCACCAGCGCTGCATTCAATCATGTTTTT 2 0 5' arm Ricinus_communis mirbase MIR397 1e-57 ptc-MIR397a 0.00000000003 -54.5 ((((((.((((((((((((((((.((((.((.((.(((.((......))))).))...(((((..((((......(((((((....)))))))....(((....)))......))))..))))))).)))).)))))))))))))))).)))))).. (-54.50)