mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGCACTGCCTCTTCCCTGGC CTGGGAACAGGCAGTGCATGG AAAGACTGGGAACAGGCAGTGCATGGATGGGGCTACTAACAGAAAACATCTGTTTTGGCTCTACCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCTTCCG 5 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR408 5e-46 ptc-MIR408 5e-21 -49.6 .(((...(((((.((((((((((.((.((((((((..((((((.....)))))).)))))))).)).)))))))))).)))))...)))... (-49.60)