mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTTGAGAGCCGTTAGATGA ATCTAACGACTCTCAGATATCA TCGACTTCACGTTGAAGTTGAATACTTGAGAGCCGTTAGATGATTTGATTGATTTGACTAAATTTTCATCTAACGACTCTCAGATATCAACTTCACGTGAAGTCAACTTCACCTGAGTTTTCACCTTAATACAAAAATAGAATTAG 3 0 5' arm Arachis_hypogaea mirbase 100 ahy-MIR3509 3e-79 -52.8 ..((((((((((.((((((((.((.(((((((.((((((((((...((((..........)))).)))))))))).))))))).)))))))))))))))))))).......................................... (-52.80)