mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGTTAATACAGAATCCTT GGATTCTGTATTAACGGTGGACA ACAATAGAAGGATTCTGTATTAACGGTGGACATGATTTATCTCGTTTTTAAAGATATCTTTGCATTTCATATGAGATTTAAAGTTTTTATTGGTAATATAAATCTCACATGAAATTTAAATTTATATTTTAAAGTTAAGATAAAGTCATGTCACCGTTAATACAGAATCCTTCAATTATATTTAGTCAGGGG 0 1 3' arm Arachis_hypogaea mirbase 100 ahy-MIR3514 1e-106 -72.17 ......((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...(((((((((((..((((.(((((((.(((((((((..................))))))))).))))))).))))..))).))))))))...)))).)))))))))))))))))))))))))))))))................... (-72.17)