mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGTAGAAAATGAACGGTAT ACATTTCATTTTCTATACTCA GGAGGAGAATCAATAATGTTATTTCTACATTTCATTTTCTATACTCATTCTCTGCACCTTCCTTTTATGTATGATAAAGGAAAAAATATAAATTTTTCTATTATTTTGTCATAAAAGTGAGGTGTAGAGTAAAAATGTAGAAAATGAACGGTATAAATAACATTGATGTTGAGA 5 0 3' arm Arachis_hypogaea mirbase 100 100 -62.9 .........(((((((((((((((.(((..(((((((((((((......((((((((((..((((((((((.(((((.(((((((.......))))))).))))).)).))))))))..))))))))))......)))))))))))))..))).)))))))))...)))))).. (-62.90)