mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCATGTCACATCGGATATTT ACATCTGATGTGACTTGGGC AGTCCATGTCACATCGGATATTTGGACACTAATTTGGAGTATTAAACATACATTAATTACAAAACCTATTCCATAAGCTTGGACTAATTCGCGAGACGAATCTTTTGAGTCTAATTATGTCATGATTTTGACAATGTGATGCTACAGTAAACTTTTGATAATTATGGATTAATTAGGCTTAAAAAAATCGTCTCGCGGATTAGCTCTCATTTATGAAATTAGTTTTTTTATTAGTCTATGTTTAATACTCTAAATTAGCGTTCAAACATCTGATGTGACTTGGGC GCATGGTCGGCGATGTCGTAGCCGCCGGATCCGGCTATCTCTATCGAGTCCAGTCGCTTTTTGGCGAGGCGCTGCCGCGACCGCCGCCGGATCGGGGTCGTCCATCGCCGTCGCGAGCGCCGTGTGGCTCTCACGTCGTTGGGGGCTGCCGAAGCCGAGCGGGGAAGCACGTGCGCGATCTCCGGTTAGTTGAAGAGGACGGGGGTGGCGCGGCCCTTGATGGCACGGCGGTGGCAAACGTGCAGAGCCAGATGCGCGAGTTCTTGCGCAGCTCTCAGATCTCCGACACCCACTTGCCCCAACTCCACATGCTGCTGCTAGATCCAACGGGCGGCGAGCTTCGTCGGTGGAGAGCTTTTGCGCCGACTGCTCGAGCATCCAGCAAAATGTAAGGTGGAGGTGGTGCGGTGGTTGGGTCACGGATCGGCCAGGGTGGCGAGCCTGGGGGAATTGGCAGGCAGGCAAAGGAGGGAAAGACGGGCCAAACATTAAAAAAAAATAAAGGTTGCCAGTGGAAGAAAACAAACTGTAGAAGGCAAATCCGGTGACTTGGAGCTGCTAAGGGGCTGTTTGGTTTCCAGGGACTTATTCCAAGTCCATGTCACATCGGATATTTGGACACTAATTTGGAGTATTAAACATACATTAATTACAAAACCTATTCCATAAGCTTGGACTAATTCGCGAGACGAATCTTTTGAGTCTAATTATGTCATGATTTTGACAATGTGATGCTACAGTAAACTTTTGATAATTATGGATTAATTAGGCTTAAAAAAATCGTCTCGCGGATTAGCTCTCATTTATGAAATTAGTTTTTTTATTAGTCTATGTTTAATACTCTAAATTAGCGTTCAAACATCTGATGTGACTTGGGCTAAAAAGTTTTAGCCCCATCTAAACACCCCCTAAGCAAATCCGGCGACTTTTGCTATCTCGCTGTTCTGATTGCCAGCAAATTTGATGATTTGGAGCTGCTAAGCAAATCCGGCGACTTCTGCTATCTCGCTGTTCTGATTGCCAGCAAATTTGATGATTGCCACTGGTTGCATGTTGTTTGCTATTGACTTGATTTGTTGTTGGCTGTGGGATGTGAATCCGATCGTCAAAGCAGTCGGTTTCGGTGACAGTCATAGCAGTCGGTTTCGGTGAATAATAGCAGTAGTTTGGAAAAGTTTTGGCTATAGGAATCTTTGCATGTCAATCCGTGTGCTACACTGTTTCAGTGAAAAGTAGTAGTATTTTTATGTCGTGCTATGAGTAGTACTCCCTCCCTCCGTATAAGCATATTTTCAAATCTGAAAATTCTATGAAAATTCTATTTTTGATAAGCAAAAA 2 0 5' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR445a 2e-75 -116.4 .(((((.((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((((((.((((((...(((((..(((.((((((...(((((((((((((((((((...(((((((((((((((..((((((((....(((.((.((......))..))..)))..))))))))..)))))))))))))))...)))))))))))))))).)))..)))))).)))..)))))...)))))).)))))))))))))))))))))).))))))).)))))))))))).))))) (-116.4)