mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA GAGTTCCCTGCACTCCAAGTC AAACCCAACTTGGAGTTCCCTGCACTCCAAGTCTGAAAGGATATGATGGTAAACCTCTACTGCTAGTTCATGGATACCTCTGACTTCTTAACAACATGCGTTCGAAGTCAAGGGTTTGCATGCCCTGGGAGATGAGTTTACCTTGATCTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCAGAGGGTATTC 2 0 3' arm Glycine_max mirbase MIR159 0.00000001 gma-MIR159c 0.00000000001 -85.8 ..((((...((((((((((((.((((((((..(..(((((.((....(((((((.((..((.((((..((((.(.(((..(((((((..(((.......))).)))))))..))).).))))..)))).))..))))))))).)).)))))..)..)))))))).)))))))))))).)))).... (-85.80)