mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG ACGGAAGCTTTGTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACCCTTCTTCATCTTGATCTTGTGTAGACTACTATGCTTGTGGTCAAGGAATACATAGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATATGCTTCCAAA 4 0 3' arm Glycine_max mirbase mir-166 0.000000000009 ctr-MIR166 0.00000000000003 -62.12 ..((((((..(((...(((.((((((((..((((((..(((.(((.((......((((((((..((((((....))))))....)))))))).......)).))).)))..))))))..)))))))).)))..))).))))))... (-62.12)