mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTGTTTGGCTATG AAGAGGAAGAGAGAGTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGTTATTATTTGCTCATGTTCATGCTCACCGGTTTCCTTGCCGGCAAGTTGTGTTTGGCTATGTTTTGCTCTCTTCTTCT 4 0 5' arm Glycine_max mirbase MIR169_2 0.000002 mtr-MIR169b 0.00000000003 -57.2 .((((((((((((...(((..(((((((.(..(((((((((((.....(((((..(((....)))..))..))).....)))))))))))..).)))))))..)))...)))))))))))) (-57.20)