mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAGGTCATCCTCTGGCTATA AAGTGGGATGAAGCCAAGGATGACTTGCCGACATTAATTTGCCATTAAGCTAACGAGTTAGGTAGAATCATTTGTTAGATTTTCCCGGCAGGTCATCCTCTGGCTATATTTGGCT 2 1 5' arm Glycine_max mirbase MIR169_2 0.000002 ptc-MIR169a 0.000001 -46.4 .(((.(((((.(((((((((((((((((((...(((((.....))))).(((((((((...........))))))))).......)))))))))))))).))))).))))).))) (-46.40)