mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GTAGCATCATCAAGATTCACA TTGACAGTCGTTGTTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATGAAGGTGGGTGGGACTATGATGCAATCCAAGTGCTCTGCCAATCCATCGGTCTTTTTGATGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGGCTTTAA 1 0 3' arm Glycine_max mirbase mir-172 0.0000000000006 gma-MIR172a 4e-32 -67.2 .....(((((((....((.(((((((((((((((((((((.((((((((.((.(((((((.((.(...((.(((.......))))).))).)))))))..))..)))).)))).))))))))))))))))))))).))....))))))).... (-67.20)