mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCAG GGAGCATCATCAAGATTCACA AAATCAGTCACTGTTTGCCGGTGGAGCATCATCAAGATTCACAAGCTTTAGGGGCATTAATTTGTTTGAGGTGGTTCCTTATTGCTCCAAAACCAATTAGCCCTTTTGCTATGGGAATCTTGATGATGCTGCAGCAGCAATAAATGACTAATA 3 0 3' arm Glycine_max mirbase mir-172 0.000000000002 gma-MIR172e 3e-67 -64.7 .....(((((....((((.(.((.((((((((((((((((.(((((...((((((..(((((..((((..(..((.....))..)..))))...)))))))))))..))).)).)))))))))))))))).)).).))))....))))).... (-64.70)