mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCAGCAG GGTGGAGCATCATCAAGATTCACA AAAACAGTCACTGTTTGCCGGTGGAGCATCATCAAGATTCACAAGCTTTAGGGGGCATTAATTTGTTTGAGGTGGTCCCTTATTGATCCAAACCAATTAGCCCTTTTGCTATGGGAATCTTGATGATGCTGCAGCAGCAATAAATGACTAATA 4 0 3' arm Glycine_max mirbase mir-172 6e-16 gma-MIR172c 3e-67 -64.7 .....(((((....((((.(.((.((((((((((((((((.(((((...(((((((..(((((.(((((.(((.(........).)))))))).)))))))))))).))).)).)))))))))))))))).)).).))))....))))).... (-64.70)