mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCA TAGCATCATCAAGATTCACA GCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAACGCAGGTGGTGGGTGGGACTGTGATGCAATCTAAGTGCTACTGTGCCAACCAAAGCCATAGGTCTTTTGGAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGC 1 0 3' arm Glycine_max mirbase mir-172 0.0000000005 gma-MIR172a 2e-46 -62.4 ((.(((((((((((((((((((((.(((.((((.((..(((((.(((((.((.(((..((.......))..))).)).)).)))...)))))..))..))))...))).))))))))))))))))))))).)) (-62.40)