mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCC GAGCTTTCTTCAGTCCACTC CGTTGAAGACCCTAAGGTAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGACAGTAAGATTCAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAAATGTTGAGTGTAAGCGAATAAATATACTCAGCAGATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGTTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTCCTTTTGTCTCTTAC 4 0 3' arm Glycine_max mirbase MIR159 4e-55 gma-MIR319b 4e-76 -93.2 ......((((...((((.(((.(((((..((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..(((((((..((..(((((((((((..........)))))))))))..))..)))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...))))))))))..))))).)))..))))..))))..... (-93.20)