mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAAGGAGCTCCT GAGCTTCCCTCAGCCCATTC TTGGGAGGGAAAGAGAGTGAAGGAGCTTCCCTCAGCCCATTCATGGAGATAACGAAAGATTGGGTTGCTGAATTAACTGCTAGCTCACACATTCATTCATACAATAGTATTCAATTAGGGTAATATTGTGTGAATGAAGCGGGAGTATATAGTATCTATATTGCAACCCTCTTTCTCTGTGCTTGGACTGAAAGGAGCTCCTTCTTTTTCTGCTCCCTCCA 4 0 3' arm Glycine_max mirbase MIR159 0.00000000006 pvu-MIR319c 1e-17 -104.6 ...(((((((.((((((.(((((((((((..((((.(((..((((((((...(....)...(((((((.....((..(((((((((.(...(((((((((((((((.(((((.....))))).)))))))))))))))...)))))...)))))..))....)))))))....))))))))..))).))))..))))))))))).))))))..))))))). (-104.60)