mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTGGGCATACTGTCAACT TGGCATTCTGTCCACCTCC TAACAGAGTTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCACTTCCTACTCTCTCTCTGAGCCACATGTTCGTGAAGTTGGAGGTGGGCATACTGTCAACTGAGTTCTGTTG 3 0 3' arm Glycine_max mirbase MIR394 0.0000000001 gma-MIR394a 4e-22 -42.4 (((((((..(((((((((.(.(((((((((((((((((.((.(((.....)))......))..).)))).)))))))))))).).)))))).)))..))))))) (-42.40)