mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA CTCAAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTATGCATCTTATATCTCTCCACCTCCAGGATTTTAAGCCCTAGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAATATGGCAATTCAGGCT 1 0 5' arm Glycine_max mirbase MIR396 5e-19 gma-MIR396d 7e-52 -49.3 ....((.((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((...((.......(((.((........))))).....))...))))).))))))))))))))))))).))))))....)))))) (-49.30)