mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GTTTAAGAAAAATGTGGAAAA CAACAAGTCCTGTTATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTATGCCTAGTGCAATTATTGATGTGGCATAGAAGTTTAAGAAAAATGTGGAAAAACATGTCAAATCTAGGACTT 2 0 5' arm Glycine_max mirbase MIR396 0.000000007 gma-MIR396d 0.000000000002 -47.5 ....((((((((.((((.(((((((((..((((((((((((((.(((((.....((.....))....)))))))))))))))))))..))))))))).)))).......)))))))) (-47.50)