mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT GGAGTGGATCTGAGAACACAAG AGTCCAAATGGTTTATCTCAGAGGAGTGGATCTGAGAACACAAGGCTGGTTTGCACTGCTATATTATGATCGATTGGTATAAGGTGAATTTACTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGAGCCAACCTGTTGACAT 1 1 3' arm Glycine_max mirbase MIR398 0.00000003 gma-MIR398a 3e-45 -56.9 .(((.....((((...((((((((.(((.((((((((((((((((..((((..(.((..(((((((........))))))))))..))))..))))))))))))))))))).))))))))..))))....))).. (-56.90)