mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCAGGCTCTGATACCATG TGGTATCAGGTCCTGCTTCA TCAGCCGTGGTATCAGGTCCTGCTTCATCAAGTGGTCTTGTGTTCAAATCCAGCCTCAAGCACATGGTTAACCAGGCTCTGATACCATGGTGAATATAA 3 0 3' arm Glycine_max mirbase 100 100 -38.6 (((.((((((((((((..((((.((.((((.(((..((((.(((.......)))..))))))).)))).)).))))..)))))))))))))))...... (-38.60)