mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTCTTGGTCAATGTCGTTCGAAA TTGACCGACATTAGACATGACTAT GCTAGGTATTTTTGACCGACATTAGACATGACTATTTTTAGTCGACATTGACTAAGTTTTTACAGTCGACATCCACTAGAGTTTTTTCGATCGACATCGGTCAAAGCAATTTTTTAGCCAACATCAATCAAGGCTATTTTATAGCCGATGTTGGGTAGGGTTTTTTATTCGACATCAGTCAGGGCTATTTTTTAGCCAACTTCGACTAGAGATTTTTCAGCCAACATTGACTAATGATGTTTTTCAGTCGACATCGGGTAGGTTCTATTGGTCGGCATCGACCAAGCTATTTTTTAGTCGATACTAGATAGATTTTTTTGTCAACGCCTGCTAGGATTTTTTAGGTTGACGTTGGCTAAAAATAGTCTTGGTCAATGTCGTTCGAAAAAACCCTAGT 3 2 3' arm Glycine_max mirbase 100 100 -135.7 ((((((..(((((((.(((((((.(((..(((((((((((((((((..(((((..((....)).(((((...........(((((...(((((....))))))))))....(((((.((((((((......((((((...)))))))))))))).)))))........)))))...))))).(((((.....)))))....((((((.((((..((..(((....(((((((((.((((((........))))))............(((((((....)))))))........)))))))))....((((((....)))))).......)))..))..)))).)))))).)))))))))))))))))...)))))))))).)))))))...)))))) (-135.70)