mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTGTTGCAAAATAGTCATT AGACTATTTTGCAATACTTATG TATCTTTACATAAGTGTTGCAAAATAGTCATTCCGTTAAATTTTAAAGTAACACCGTTAGTGAGATCAATTTTAGTGCCACGTGAACTATCCAATATAGCACTAAAGGATGACGTGACATGACATGTGGACGTGTCTCCTAAAAGATGTCACGTCATTTTGAAAGTCCACGAGACATTTCACAACCTTTGCAATGCATGGACACTTTAAGCACGATTTCTGACATCTTTTAAGTTAGAGACTATTTTGCAATACTTATGCAAAAGAT 3 0 5' arm Glycine_max mirbase 100 100 -86.1 .((((((.(((((((((((((((((((((....(((.....((((((((..........((((((((((.((((((((....((.......)).....)))))))).(((((((((((((((((((....)))))).........)))))))))))))))))..(((.....))).))))))..((..(((...))).))..)))))))).)))...((((((.........)))))))))))))))))))))))))))..)))))) (-86.10)