mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCCGATTCCACCCATTCCTA GGAGATGGGAGGGTCGGTAAAG TGAGGAAGTGATGGGAGATGGGAGGGTCGGTAAAGGATAACAGCGTCTCTATGATTAATTGTTGTGTTGTTTATTCTTTTGCCGATTCCACCCATTCCTATGATTTTCTTT 1 2 3' arm Glycine_soja mirbase 100 pvu-MIR2118 0.00000000009 -47.9 .((((((((.(((((((.((((.((((((((((((((.(((((((.(..((........))..))))))))...))))))))))).))).))))))))))).)))))))). (-47.90)