mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCGAGGAGCCATGCATG AGATATATATACTAATTGCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTAGAGTTCATCAAGATGTTGATGACTTTAATGAATGGCGTGCGAGGAGCCATGCATGTTGTGTATATTTTCTAT 2 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase mir-160 0.000000000007 mtr-MIR160d 0.0000000000004 -59.8 (((.((((((((.....((((((.(((((((.(((((((((((..((((((.((((((....))))))))))).)..))))))))))).))))))).)))))).))))))))..))).. (-59.80)