mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCCCTCTTCCCCATC CAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCAATACTAACTCATGAACATACACACATGATGGAAGTGAATACAAAGAGAATCTACATTCTCTTATGTTTCATTTTTTTAATTGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCCTCTTCCCCATCATGA 5 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase MIR164 3e-64 ptc-MIR164e 0.0000000000005 -57.4 ((.(((((.((((..(((((((((....(((((((((....(((......)))..(((((((((.(((((((((((....)))))))).)))))))))))).....)))))))))....)))))))))..)))).))))).)). (-57.40)