mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGGTGTCTGATTCGAGA CAGACATACGAAGGAGTTCAGGGGAATGGTGTCTGATTCGAGACCATTCGTCACAAGTAAACAGTAGCCTTGAGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCTAGCTCATAGTATCATGC 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-166 7e-46 mtr-MIR166h 4e-47 -48.7 .....((((....(((((..(((((((((.(((((.(((((((.(((((....((((...........)))).))))).))))))).))))).)))))))))..)))))...))))..... (-48.70)