mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGGTGTCTGATTCGAGA GTTCAGGGGAATGGTGTCTGATTCGAGACCATTCGTCACAAGTAAACAGTAGCCTTGAGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCTAGC 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-166 5e-46 mtr-MIR166 3e-47 -40.2 (((..(((((((((.(((((.(((((((.(((((....((((...........)))).))))).))))))).))))).)))))))))..))) (-40.20)