mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCCAGTTGTCCTTGGCTATG AAGAGGCAGAGAGAGTAATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACAACGTTGGCGAATGTTCATGTGATTTCTGCCTCATTGTGCCGGCCAGTTGTCCTTGGCTATGTTAGTCTCTCATCTTCT 5 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase MIR169_2 0.000007 mtr-MIR169a 1e-59 -58 .(((((..((((((.((((..(((((((((..(((.((((.((.....((((((...((....)).))).)))......)).)))).)))..)))))))))..)))).))))))..))))) (-58.00)