mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGGTATCCTAGGCTTTT TTTATAAGCCAAGGATGACTTGCCTAGCTAAAAACCATTTACATTAATTGGGGACTTAATTTGTATATGTTATGTCTGATCGATGATGAGTATGTCCCTTGTTTAGTTTATTAGCAGGCAGGTATCCTAGGCTTTTTGA 2 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase MIR169_2 7e-74 sbi-MIR169h 0.000002 -44 .....(((((.((((((.(((((((.(((((((((.....(((......((((((...(((..(....((((....)))).....)..)))..)))))))))...)))).)))))))))))))))))).)))))..... (-44.00)