mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCCTGATGATGCTGCAG GGAGCATCATCAGGATTCACA GCCGGTGGAGCATCATCAGGATTCACAAGATTTTGAAGGGTTTAATTTGTTTTGATTGTTTCAAATAGATTAGCCCTTTGACATATGAGAATCCTGATGATGCTGCAGCTGCA 3 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-172 2e-58 ath-MIR172c 0.00000009 -55.2 ((.(.((.((((((((((((((((.((..((.(..(((((((.(((((((((.((.....))))))))))))))))))..).)).)).)))))))))))))))).)).).)). (-55.20)