mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCTTTGAACGCTTCATGC TTTTTGTTGATTGTTTCTTAGAGTTCCTTTGAACGCTTCATGCATGAGAATATGTATTTGGTCTAATATCCATTAGAAAAGATAGTTCTTCATCAATGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGGTTCAACCAGCACCA 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-395 4e-60 mtr-MIR395q 4e-41 -55.8 ....(((((.(((..(((.((((((((((..((((((((((..((((((((...(((((..((((((....))))))..))))))))).))))..))))))))))..)))))))))).)))..))).)))))... (-55.80)