mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCTTTGAACGCTTCATGC TCTTAGAGTTCCTTTGAACGCTTCATGCATGAGAATATCTATTTGGTCTAAAATCCATTAGAAAAATAGTTCTTCTTAAATGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGG 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-395 1e-53 mtr-MIR395d 5e-49 -47 .((.((((((((((..((((((((((...((((((...((((((..(((((......))))).))))))...)))))).))))))))))..)))))))))).)). (-47.00)