mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAGCTGCCCTA GGGCATGTCTCTATTGGCAGG AGTCATAGGGCATGTCTCTATTGGCAGGTGATATAGTGATATGGCTCTAGAAATTCACTTGCCAAAGGAGAGCTGCCCTATGAAT 3 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-399 0.00007 mtr-MIR399n 7e-17 -44 ..((((((((((..(((((.(((((((((((..(((.(......).))).....))))))))))).)))))..)))))))))).. (-44.00)