mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAGCTGCTCTT GGGCATATCTCCTTTGGCAGG GTAAGCAAATCATTCAAAGGGCATATCTCCTTTGGCAGGTATAATGGGTGGTTGCTAGTTTATTTTACATCTATATTAAAATTTTATGTGTTTATTTATCAAATAAAAAATAAAAAAAACTATCATGGTAAACAACTTGCCAAAGGAGAGCTGCTCTTTGAGTGTTTAGCTTAG 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR399b 0.0000000001 -61.23 .(((((.((.(((((((((((((..(((((((((((((((...(((((((.................))))))).......((((((...((((((.....))))))..))))))...................)))))))))))))))..))))))))))))).)).))))). (-61.23)