mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTGCATCCTGAGGTTTA AGCCTTAGAATGCAGATTATC AGATTGGGATCAGATGAGATAATCTGCATCCTGAGGTTTAGAACAATCGATGCGTAACTGTATCTAAGCCTTAGAATGCAGATTATCTCTTCCTTATCACCAATGCA 1 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2111c 7e-33 -47.92 ..((((((((.((..((((((((((((((.(((((((((((((((.............))).)))))))))))).))))))))))))))...)).))).)))))... (-47.92)