mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGGATTAGCGATTACAGGGAC CCATGTATTCGCTAATCCTTGC TAGGGGCCGTTTAAAAATTGGTCCATGTATTCGCTAATCCTTGCAAACTAGTCTTGCAATCATTAATCATTTAAAATTTCATCATTTGACCAACTTAATCACTGCCACACATAAAATTCCAATTCTGCCCTTAAGAAGATGACAAAATATTGAAGAAAGAATTGGAAACCTAGGGGTAAAATTGGAATTTCATGTGTAACAGTGATTGACACGTCATCAAATTCTTGACGTGGCAGTGATTAAGTGGGGAGAGGGACGAAATTTTAAATGATTAAACAATGCAGTGGTGAATTGTCAGGATTAGCGATTACAGGGACCAATTTTTAAACGACCCCT 3 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2585c 3e-44 -152.4 .(((((.(((((((((((((((((.((((.(((((((((((.((((..((.(.(((((....((((((((((((((((((.((.(((..((.(((((((((((((.((((((.(((((((((((.((((((((.........(((....)))...........(....).)))))))).))))))))))).))))))............(((((((.........)))))))))))))))))))).))..))).)).))))))))))))))))))....))))).).))..)))).))))))))))).)))).))))))))))))))))).))))) (-152.40)