mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGGATTAGCGATTACAGGGAC CCCTGTAATCGTTAATCCTGGT TAGGCGTCATTTAAAAATTAGTCCCTGTAATCGTTAATCCTGGTAATTTGTCCTTGCATTATTTAATCATTTAAAATTTCGTCCTTTGACAAACTTAATCACTCCCAAGTCATCAAATTAGCAAAATGGCATGGAAATGGACAAAAATACCCTCGTCTTTATTATGAGAAGAAGATGAAGACAGGGATAAAAATGTCATTTCACGAATGGATGACGAGGGTATTTTTGTCCATTCCCATGTCATTTTGCTAATTTGATGACGTGACAGTGATTAAGTTGGTCAAAGGACGAAATTTTAAATGATTAAACAATGCAAGGGTAAATTGTCAGGATTAGCGATTACAGGGACTAATTTTTAAATGACGCCT 0 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2585e 0 -238.5 .(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((..(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((..((.((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((......((....))..((((....)))).)))))..)))))).)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).))..)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))) (-238.50)