mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACACTGTGCAACTAAGTCC ACTTAGTTGTATACTGTTACA AGATAGGTCCTTTAACTTTGTAACACTGTGCAACTAAGTCCTTCCGTTAACAAAACATTTATTTTCTTAAAACAAAACACTTAACACATTACATTAATGTTACACTCAACAATGTTTCATCGTCTAACATGATTGCACGCTTAAATTAAACTAAAAAAAACAACATGTTACAAGGATTGTTCACTTTACTTGAATAAATATCAAGCTTATTGTTGCAATAACACAAGTTAAAGCCAACAACATGCAAGTTACATCAGCAATCTTCAAAAATAATCATAACATTTTCCAATTAATAACATGTTTTTGCCTTTTGCATGCCACATCACAGACTTCAGAGTCACGTCAGCGTTTTTTTGACGGTGAGTTAACGGAAGGACTTAGTTGTATACTGTTACAAAGTTAAAGGACCTATCTG 1 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2588b 0 -127.8 (((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((..................................((((((...))))))................((((((((.(((.((((.(((.((..((..((((...........(((((((((..(((((((((.......(((((.......)))))....(((((((..((((....))))..).))))))...............)))))))))..(((((.........)))))........)))))))))))))..))..)).))).........((((....))))..))))..))).....))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))). (-127.80)