mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCATCCACGTGTGCTTCACCG GTGAAGCACACATGGATGCCAC TGTTGGTGATTAAGCAAACGGTGAAGCACACATGGATGCCACACCTGACTTTTTTATTTTTTGTTAAATATATTTTTAATCCCTATAAAATTAAGGTATTTTAAGTTTTTATTCCTTACAAAAATATTATGCACTCAGTATTAGTCCCTGCTCAATTCAACTATTAAAATTAAACAAATTTGAATTGAGCAGAGACTAATACTGAGTGCATAGTATTTTTGTAATGACTAAAACAACTATTAAAATTAAGTAAGGACTAAACTTAAAATGTCTCAATTTTATAGGGACTAAAAACATATTTAACCCAACAAAAAAAAGTCAGATGTGGCATCCACGTGTGCTTCACCGTTTGCTCAATCAACAACG 1 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 gma-MIR1525 0.00002 -190.05 .((((.(((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((.......(((((((((.((((((.(((((((((((((.((..(((((((((((....((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...................))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))............(((..........))).))))..)))))))))))..)).))))))))))))).)))))).))))))))).......))))))))))).))))))))))).))))))))))))))))))).))))).)))). (-190.05)