mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCTAAAGGTGATTATTGTGCC CAGAATAATCACCCTTAGATTT CAAGAAAATTTCAAGAATGACATGGCAGAATAATCACCCTTAGATTTTATCAAGAAATAGTCTTGAAACTAATGTTAGCCAATAAAATCTCAGCCTGGTCGGAAATCATGGGTGGTGGGTGTTATGTATTTTTTTTTATGAAAGATTAATAAATGAGACTGAAATCTAAAGGTGATTATTGTGCCATGTCATTCTTGAATCTTT 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2590e 1e-73 -72.2 .((((....((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((.((((((.....)))))).......................(((.((((((.....)))).)).)))..(((.((((.((((..((((.....))))..)))).)))).)))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))). (-72.20)