mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATGCTTGAGTCCTGTTGTT CAACAGGACTCAAGCATTTCG AAATTCAAACCTGCAAAACAACAGGACTCAAGCATTTCGCCAAACACCTCATGTTTTCCCTTTGAAAATAATAAATTTTTGTGAGGCTTGCTTTAGATGATGGTATTCAAGTGCCACCGAATTGAGGTTCAATCCTTGACACTTAATACCTTCATCTAAACCAGCATAACAAAAATTTAATATTTTCAAAGGAGAAACATGAGGTGCTTGCGAAATGCTTGAGTCCTGTTGTTTGACAAGTTTGAATTA 0 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2592r 2e-140 -134.5 .(((((((((.((..(((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((..((((((((((((.(((((((((((...(((.(.(((((((((.((((((.(((((........(..(((......)))..)))))))))))).)))))))))).)))...))))))))))).))))))))))))..)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))..)).))))))))). (-134.50)