mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATGCTTGAGTCCTGTTGTT CGACCATGACTCAAGCATTTTG GGGTAATTCAAACTTGCCAAACGACCATGACTCAAGCATTTTGCCCAACGTTCATGTTTTTCCTTTGAAAAGATTAAATTCTTGTTATGCTGGTTTAGATGAAGGTATTAAGTGTCAAGGAATGAACATCATTTCATTGGCACTTGAATACCACCATCTAAAGCAAGTCTAACAAAATTTATTCTTTTCAAAGGAAAAACATGAATGCGGGGCGAAATGCTTGAGTCCTGTTGTTTGGCAAGTTTGACTTTACC 2 1 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2592m 2e-143 -151.1 .(((((.((((((((((((((((((...((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((.((((.((((((((..(((((((((((((((((((((.....)))))).)))))))))).)))))..)))))))).).))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))..))))))))))))))))))..))))) (-151.10)