mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATGCTTGAGTCATGTTGTT CAACAGGACTCAAGCATTTCG AGATAAATTCAAACCTGTCAAACAACAGGACTCAAGCATTTCGCTCGACGTTCATGTTTTCCTTTGAAAAGAATAAATTTTTGTTAGGCTTGCTTTAGATGATGATATTCAAGTGACAACGAAATGAGGTTCATTCCTTGACACTTAATACCTTCATCTAAACCAGCCTAACAAAAATTTAATTCTTTTCAAAGGAAAAACATGAATGCCGAGCGAAATGCTTGAGTCATGTTGTTTGGCAGGTTTGAATTTATC 1 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2592a 2e-91 -152.3 .((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(.(((((((((.(.((((.(((((.(((.(((.((.....))))).))).))))))))).).)))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))) (-152.30)