mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAATGAATGAACCTAGAAT TTTAGATTCATTCATTTAATG TTATAAGCAAAAATTTACATTTTAGATTCATTCATTTAATGATGCACATGGTCTTTATTGTAGACCACATACATCATTAAATGAATGAACCTAGAATGTAGTTTTTTTGCTTATAT 1 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase MIR1122 3e-17 mtr-MIR2593c 2e-52 -55.6 .((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((((((((....((((((.......))))))....)))))))))))))))))).)))))))))))..)))))))))))). (-55.60)