mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTTGGTATCGCTTTGGTCCC GACCAAAGTGATACCAAATAAA ATTTTGGTCCTTTAAGTATTTATTTGGTATCGCTTTGGTCCCTTAACTAAAAAAAAGATTGTTTGAGTACTTTAATTTAATTTTCGTTACATTTTTTGGTCCATTCCGTTAGGTTTAATAAAAAATGTTAAGTGTGATACACGTGTCGTTTTGGCATTGGCTCTGGAAACATTAAGGGACCAAAGTGATACCAAATAAATACTTACGGGACCAAAAG 0 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 mtr-MIR2671g 0.0007 -88 .((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((..................((((.................((((.((((..(((......)))..)))).))))....(((((((((...((((....))))..))))))))).)))).(....).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))). (-88.00)